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苹果发短信时，不提示主副卡的原因可能有以下几点。
1、未设置主副卡功能：苹果手机的短信功能默认是不区分主副卡的，需要在设置中手动开启主副卡功能，才能在使用短信时选择使用哪个号码发送短信，如果未设置该功能，则无法选择使用主卡或副卡发送短信。
2、系统卡顿或软件问题：如果手机系统卡顿或者出现软件问题，可能会导致短信功能无法正常使用，从而出现不提示主副卡的情况，此时可以尝试重启手机或者更新系统，如果问题仍然存在，建议联系苹果客服寻求帮助。
3、未设置默认号码：苹果手机可以在设置中选择默认号码发送短信，如果没有设置默认号码，则可能会出现不提示主副卡的情况，可以在设置中设置默认号码，或者在使用短信时手动选择使用哪个号码发送短信。
如果以上方法都无法解决问题，建议联系苹果客服或者前往苹果专卖店进行检查和维修，也可以尝试在设置中检查短信功能的选项，看是否有其他相关设置导致不提示主副卡的问题。